Phylogenetic relationship between rabies virus (Lyssavirus rabies) variants from two different species / Relações filogenéticas do vírus da raiva (Lyssavirus rabies) em duas diferentes espécies / Relaciones filogenéticas del virus de la rabia (Lyssavirus rabies) en dos especies diferentes

Rabies is a fatal zoonotic disease that affects several mammals. Hematophagous bats are recognized hosts of the rabies virus, and their main food source is the blood of other mammals, particularly cattle. During feeding, bats transmit the virus to cattle, which are victims of the disease, contributing to economic losses and increasing the risk of infection for humans. Based on this affinity in the rabies cycle between bats and cattle, the objective of this study was to analyze the phylogenetic relationships of rabies virus samples in cattle and bats. The G gene of the rabies virus was chosen for this study because it is directly related to the infection process. Nucleotide sequences of the viral G gene were selected from GenBank for samples obtained from infected cattle and bats. Maximum parsimony analyses were conducted using the Molecular Evolutionary Genetics Analysis software. The Maxima Parsimony tree indicated a phylogenetic relationship between the G genes of both hosts, indicating that the virus evolved from bats to cattle. Analysis of parsimoniously informative sites revealed that the viral G gene carried specific mutations in each host. Knowledge of the evolutionary relationships between the rabies virus and its hosts is critical for identifying potential new hosts and the possible routes of infection for humans.

A Raiva é uma zoonose fatal que infecta várias espécies de mamíferos. Os morcegos hematófagos são reconhecidos como hospedeiros do vírus da Raiva e sua principal fonte de alimento é o sangue de outros mamíferos, especialmente os bovinos. Quando se alimentam, os morcegos transmitem o vírus para o bovino os quais são vítimas da doença, contribuindo para perdas econômicas e riscos de infecção para humanos. Baseado nesta afinidade do ciclo da Raiva entre morcegos e bovinos, o objetivo deste estudo foi analisar as relações filogenéticas de amostras do vírus da Raiva em ambos os hospedeiros, bovinos e morcegos. O gene G do vírus da Raiva foi escolhido para esta pesquisa porque ele está diretamente relacionado ao processo de infecção. Sequências de nucleotídeos do gene G viral foram selecionadas no GenBank a partir de amostras obtidas de bovinos e morcegos infectados. Análises de Máxima Parcimônia foram conduzidas utilizando o software Molecular Evolutionary Genetics Analysis. A árvore de Máxima Parcimônia indicou uma relação filogenética entre o gene G de ambos os hospedeiros, indicando que o vírus evoluiu dos morcegos para os bovinos. A análise dos sítios parcimoniosamente informativos revelou que o gene G viral apresentou mutações específicas em cada hospedeiro. O conhecimento sobre as relações evolutivas do vírus da Raiva e seus hospedeiros é crucial para identificar nos hospedeiros potenciais e novas rotas possíveis de infecção para humanos.

La rabia es una zoonosis fatal que infecta a varias especies de mamíferos. Los murciélagos hematófagos son reconocidos como huéspedes del virus de la rabia y su principal fuente de alimentación es la sangre de otros mamíferos, especialmente del ganado. Al alimentarse, los murciélagos transmiten el virus al ganado que es víctima de la enfermedad, contribuyendo a pérdidas económicas y riesgos de infección para los humanos. Basado en esta afinidad del ciclo de la rabia entre murciélagos y ganado, el objetivo de este estudio fue analizar las relaciones filogenéticas de las muestras de virus de la rabia tanto en huéspedes, ganado y murciélagos. El gen G del virus de la rabia fue elegido para esta investigación porque está directamente relacionado con el proceso de infección. Las secuencias de nucleótidos del gen G viral se seleccionaron en GenBank a partir de muestras obtenidas de bovinos y murciélagos infectados. Los análisis de parsimonia máxima se realizaron utilizando el software Molecular Evolutionary Genetics Analysis. El árbol de Máxima Parsimônia indicó una relación filogenética entre el gen G de ambos huéspedes, indicando que el virus evolucionó de murciélagos a bovinos. El análisis de los sitios parsimoniosamente informativos reveló que el gen G viral presentaba mutaciones específicas en cada huésped. El conocimiento sobre las relaciones evolutivas del virus de la rabia y sus huéspedes es crucial para identificar huéspedes potenciales y nuevas posibles rutas de infección para humanos.

Knowledge, attitude and practices regarding dengue and its vector among medical practitioners in Malakand region, Pakistan

Abstract Dengue fever (DF) is increasingly recognized as one of the worlds major mosquito borne diseases and causes significant morbidity and mortality in tropical and subtropical countries. Dengue fever is endemic in most part of Pakistan and continues to be a public health concern. Knowledge, attitude and practices can play an important role in management of the disease. Current study was aimed to determine the level of knowledge, attitude and practices regarding dengue fever among health practitioners, to study the level of knowledge and attitude with preventive practices for dengue fever. A cross sectional study was carried out in medical practitioners of the four districts of Malakand region during October to November 2019. A pre-structured questionnaire was used to collect data from medical practitioners. Data was analyzed using Graph Pad version 5. Significant value was considered when less than 0.05 (at 95% confidence of interval). The results revealed that most of participants have seen dengue vector (62%), the media being the most quoted source of information. Nearly 81.2% participants were aware from transmission of dengue fever is by mosquito bite. Practices based upon preventive measures were found to be predominantly focused towards prevention of mosquito bites rather than elimination of breeding places. Although the knowledge regarding DF and mosquito control measure was quite high among the medical practitioners but this knowledge was not put into practice. Further studies are required to aware the people about dengue and its vector in order to get prevention and control.

Resumo A dengue (DF) é cada vez mais reconhecida como uma das principais doenças transmitidas por mosquitos do mundo e causa significativa morbidade e mortalidade em países tropicais e subtropicais. A dengue é endêmica na maior parte do Paquistão e continua a ser um problema de saúde pública. Conhecimento, atitude e práticas podem desempenhar papel importante no manejo da doença. O presente estudo teve como objetivo determinar o nível de conhecimento, atitude e práticas em relação à dengue entre os profissionais de saúde, para estudar o nível de conhecimento e atitude com as práticas preventivas da dengue. Um estudo transversal foi realizado com médicos dos quatro distritos da região de Malakand de outubro a novembro de 2019. Um questionário pré-estruturado foi usado para coletar dados de médicos. Os dados foram analisados no Graph Pad versão 5. Valor significativo foi considerado quando menor que 0,05 (com intervalo de confiança de 95%). Os resultados revelaram que a maioria dos participantes já viu o vetor da dengue (62%), sendo a mídia a fonte de informação mais citada. Quase 81,2% dos participantes sabiam que a transmissão da dengue é por picada de mosquito. Constatou-se que as práticas baseadas em medidas preventivas se concentravam predominantemente na prevenção de picadas de mosquitos, e não na eliminação de criadouros. Embora o conhecimento sobre DF e medidas de controle de mosquitos fosse bastante elevado entre os médicos, esse conhecimento não foi colocado em prática. Mais estudos são necessários para conscientizar a população sobre a dengue e seu vetor, a fim de se obter prevenção e controle.

Máscara N95 e o dilema da trajetória balística das partículas respiratórias na COVID-19 / N95 mask and the dilemma of the ballistic trajectory of respiratory particles in COVID-19 / Respiradores N95 y el dilema de la trayectoria balística de partículas respiratorias en COVID-19

Objetivo: Apresentar elementos teóricos acerca da transmissão do SARS-CoV-2 por meio das partículas respiratórias, para além do seu diâmetro aerodinâmico e trajetória balística, a subsidiar reflexões sobre a adequação do uso de máscaras pelos profissionais de saúde. Método: Ensaio acadêmico com o uso de dados de revisão narrativa da literatura. Resultados: Clarifica a confusão acerca dos termos gotículas, núcleos de gotículas, aerossóis e par-tículas, divergências que contribuem para entendimentos diferenciados sobre os mecanismos de transmissão desse agente etiológico, levando à adoção de distintas medidas de intervenção para o controle do vírus. Apresenta dados da transmissibilidade do SARS-CoV-2 pelo ar, a despeito das dificuldades técnica e metodológica para a detecção desse agente em tal meio, situação que dificulta conclusões contundentes acerca da transmissão aérea do pató-geno.Conclusão: Acredita-se ser um erro usar a falta de conclusões sobre a identificação do SARS-CoV-2 em amostras de ar para questionar a transmis-são aérea e, igualmente, para recomendar medidas de prevenção segundo o tamanho aerodinâmico dos vírus. Assim, o uso da máscara N95 por profis-sionais de saúde durante pandemia deve ser medida basilar e inequívoca para a proteção e a segurança dessa população.

Objective: To present theoretical elements about the transmission of SARS CoV-2 through respiratory particles, in addition to its aerodynamic dia-meter and ballistic trajectory, to support reflections on the adequacy of the use of masks by health professionals. Method: Academic essay using narrative review data from the literature. Results: Clarifies the confusion about the terms droplets, droplet nuclei, aerosols and particles, divergences that contribute to diffe-rentiated understandings about transmission mechanisms of this etiological agent, with the adoption of different intervention measures to control this virus. It shows data on the transmissibility of SARS-CoV-2 by air, despite the technical and methodological difficulties for detecting this agent in the air, a situation that hinders hard conclusions about the aerial transmission of this pathogen. Conclusions: It is believed to be an error to use the lack of sars-cov-2 identification conclusions in air samples, to question airborne transmission, also to recommend prevention measures depending on the aerodynamic size of viruses. Thus, the use of the N95 mask by health professionals during the pandemic should be a basic and unequivocal measure for the protection and safety of this population.

Objetivo: Presentar elementos teóricos sobre la transmisión del SARS CoV-2 a través de partículas respiratorias, además de su diámetro aerodi-námico y trayectoria balística, para apoyar reflexiones sobre la adecuación del uso de mascarillas por parte de los profesionales sanitarios. Método: Ensayo académico utilizando datos de revisión narrativa de la literatura. Resultados: Aclara la confusión sobre los términos gotitas, núcleos de gotitas, aerosoles y partículas, divergencias que contribuyen a entendimientos diferenciados sobre los mecanismos de transmisión de ese agente etiológico, con la adop-ción de diferentes medidas de intervención para controlar ese virus. Presenta datos sobre la transmisibilidad del SARS-CoV-2 por vía aérea, a pesar de las dificultades técnicas y metodológicas para detectar ese agente en el aire, situación que dificulta duras conclusiones sobre la transmisión aérea del pató-geno. Conclusión: Se cree que es un error utilizar la falta de conclusiones sobre la identificación del SARS-CoV-2 en muestras de aire para cuestionar la transmisión aérea e, igualmente, recomendar medidas de prevención según el tamaño aerodinámico de los virus. Así, el uso de los respiradores N95 por parte de los profesionales sanitarios durante la pandemia debe ser una medida básica e inequívoca para la protección y seguridad de esta población.

Caracterización clínico-epidemiológica de pacientes con VIH/sida en el municipio Manuel Tames, Guantánamo

RESUMEN Introducción: En el municipio Manuel Tames, de la provincia de Guantánamo, no se han realizado estudios que caractericen los pacientes con infección por VIH/sida. Objetivo: Caracterizar clínico-epidemiológicamente a los pacientes con VIH/sida, pertenecientes al municipio Manuel Tames, Guantánamo. Método: Se realizó un estudio descriptivo, transversal, retrospectivo que abarca el periodo comprendido entre 1988-2020. La población estudiada fue de 46 pacientes con el diagnóstico de VIH/sida. Se estudiaron las siguientes variables: edad, sexo, estado civil, año de diagnóstico, clasificación clínica, fuente de pesquisa, esquema de tratamiento, enfermedades concomitantes. Resultados: Los pacientes más afectados se encontraron entre las edades de 25 a 34 años (n=18; 31,9 %), en el sexo masculino (n=28; 60,9 %). El mayor número de los pacientes se encontró soltero (n=37; 80,4 %). La fuente de pesquisa más usual fue la categoría de captado (n=11; 23,9 %). El mayor número de pacientes se halló en la categoría A (n=33; 71,7 %), lo que respalda la cifra de que 32 pacientes (69,6 %) no tuvieran ninguna enfermedad asociada a la infección por el virus. El mayor porcentaje de los pacientes utilizó el esquema terapéutico de Dulutegravir + Trubada (n=26; 56,5 %). Conclusiones: Se puede concluir que la infección por VIH/sida es una enfermedad que se observa en las edades medias de la vida, con un aumento del número de infecciones en tanto pasan los años. Cuando los pacientes mantienen un esquema de tratamiento se observan menos enfermedades concomitantes y se mantienen en las categorías clínicas que menos complicaciones presentan.

ABSTRACT Introduction: No studies have been conducted to characterize patients with HIV/AIDS infection in Manuel Tames municipality, Guantánamo. Objective: To characterize clinically and epidemiologically the HIV/AIDS infected patients in Manuel Tames municipality, Guantanamo. Method: A descriptive, cross-sectional, retrospective study was carried out, covering the period 1988-2020. The studied population consisted of 46 patients with a diagnosis of HIV/AIDS. Variables studied were as follow: age, sex, marital status, year of the diagnosis report, clinical classification, source of information, scheme of treatment, concomitant diseases. Results: Patients 25 to 35 years old were found as the most affected (n=18; 31.9%), with a predominance of males (n=28; 60.9%). Most of patients were found single (n=37; 80.4%). The most common source of information was the capitated category (n=11; 23.9%). Most patients were found in category A (n=33; 71.7%), which supports the figure that 32 patients (69.6%) had no disease associated with virus infection. The highest percentage of patients used the Dulutegravir plus Trubada treatment scheme (n=26; 56.5%). Conclusions: As an end point of the outcome it can be said that HIV/AIDS infection is a disease seen in the middle ages of life, with an increasing number of infections as the years go by. When patients maintain a correct treatment schedule, fewer concomitant diseases are observed and they remain in the clinical categories with the fewest complications.

RESUMO Introdução: No município de Manuel Tames, província de Guantánamo, não foram realizados estudos que caracterizassem pacientes com infecção por HIV/AIDS. Objetivo: Caracterizar clínico-epidemiologicamente os pacientes com HIV/AIDS, pertencentes ao município de Manuel Tames, Guantánamo. Método: Foi realizado um estudo descritivo, transversal e retrospectivo abrangendo o período de 1988-2020. A população estudada foi de 46 pacientes com diagnóstico de HIV/AIDS. Foram estudadas as seguintes variáveis: idade, sexo, estado civil, ano do diagnóstico, classificação clínica, fonte de investigação, esquema de tratamento, doenças concomitantes. Resultados: Os pacientes mais acometidos estavam na faixa etária de 25 a 34 anos (n=18; 31,9%), no sexo masculino (n=28; 60,9%). O maior número de pacientes era solteiro (n=37; 80,4%). A fonte de pesquisa mais comum foi a categoria recrutada (n=11; 23,9%). O maior número de pacientes foi encontrado na categoria A (n=33, 71,7%), corroborando a cifra de que 32 pacientes (69,6%) não apresentavam nenhuma doença associada à infecção viral. O maior percentual de pacientes usava o esquema Dulutegravir + Trubada (n=26; 56,5%). Conclusões: Pode-se concluir que a infecção pelo HIV/AIDS é uma doença que se observa na idade média da vida, com aumento do número de infecções com o passar dos anos. Quando os pacientes mantêm um esquema de tratamento, menos doenças concomitantes são observadas e eles permanecem nas categorias clínicas que apresentam menos complicações.

Swinepox dermatitis in backyard pigs in Northeastern Brazil / Varíola em suínos no Nordeste do Brasil

This article describes five outbreaks of swinepox in backyard pigs in Northeastern Brazil. It affected backyard pigs from herds of poor hygienic-sanitary conditions with severe fly and lice infestations. The morbidity ranged from 33.3 to 100% among affected herds, with mortality reaching up to 60%. The affected pigs developed multifocal to coalescent gray to white papules and blisters in the skin, with eventual eruptions, evolving to erosions and crusts. In addition to skin lesions, affected piglets presented apathy, anorexia and fever. The disease was auto-limiting, resolving within 15 to 25 days. Histological examination revealed proliferative and ulcerative vesiculopustular dermatitis with ballooning degeneration of epithelial cells, perivascular inflammatory infiltrates of lymphocytes, plasma cells, neutrophils, eosinophils and some macrophages in the dermis. Intracytoplasmic eosinophilic inclusions were consistently observed in keratinocytes. Total DNA extracted from fresh tissue fragments obtained from one outbreak and formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue from the other four outbreaks was submitted to polymerase chain reaction (PCR) for Swinepox virus (SWPV) and Vaccinia virus (VACV). Genetic SWPV material was identified by PCR in fresh material from one outbreak. Nucleotide sequencing and phylogenetic analysis of the PCR amplicons (viral polymerase gene) demonstrated 100% homology with sequences from SWPV. All tissues were PCR negative for VACV. Swine poxvirus is present in backyard pigs in Northeastern Brazil, indicating the need of including SWPV in the differential diagnosis of dermatitis in pigs.(AU)

Em cinco surtos de varíola em suínos no Nordeste do Brasil foram acometidos leitões e suínos adultos, de rebanhos domésticos criados em condições higiênico-sanitárias precárias, que apresentavam graves infestações por moscas e piolhos. A morbidade variou de 33,3-100% entre os rebanhos afetados e a mortalidade atingindo 60%. Os animais afetados desenvolveram pápulas cinzentas ou esbranquiçadas coalescentes e vesículas, que evoluíram para erosões e crostras. Além das lesões de pele, os leitões afetados apresentavam apatia, anorexia e febre. A doença foi autolimitante, com resolução em 15 a 25 dias. Histologicamente, observou-se dermatite proliferativa e ulcerativa com degeneração balonosa das células do epitélio, infiltrado inflamatório perivascular de linfócitos, plasmócitos, neutrófilos, eosinófilos e escassos macrófagos na derme. Inclusões eosinofílicas intracitoplasmáticas foram consistentemente observadas em queratinócitos. DNA total extraído a partir de fragmentos de tecido frescos obtidos a partir de um surto, e de tecido fixado em formol e embebido em parafina dos outros quatro surtos, foram submetidos à reação em cadeia da polimerase (PCR) para o vírus da varíola suína (SWPV) e o vírus vaccínia (VACV). Material genético do SWPV foi identificado por PCR em material fresco de um surto. O sequenciamento e análise filogenética dos produtos de amplificação da PCR (gene da polimerase viral) demonstraram 100% de homologia com sequências do SWPV. Todos os fragmentos de tecidos foram negativos para VACV na PCR. Este artigo relata a circulação de poxvírus suíno no Nordeste do Brasil, indicando a necessidade de incluir SWPV no diagnóstico diferencial de dermatite em suínos.(AU)

Hepatitis D virus infection in the Western Brazilian Amazon - far from a vanishing disease / Infecção pelo vírus da hepatite D na Amazônia brasileira - longe de uma doença em declínio

INTRODUCTION: A decline in hepatitis D virus (HDV) occurrence was described in Europe and Asia. We estimated HDV prevalence in the Brazilian Amazon following hepatitis B vaccination. METHODS: This is a cross-sectional survey of HDV measured by total antibodies to HDV (anti-HD T). RESULTS: HDV prevalence was 41.9% whiting HBsAg carries and was associated with age (PR = 1.96; 95% CI 1.12-3.42; p = 0.01), hepatitis B virus (HBV) infection (PR = 4.38; 95% CI 3.12-6.13; p < 0.001), and clinical hepatitis (PR =1.44; 95% CI 1.03-2.00; p = 0.03). Risk factors were related to HDV biology, clinical or demographic aspects such as underlying HBV infection, clinical hepatitis and age. CONCLUSIONS: Our study demonstrated that HDV infection continues to be an important health issue in the Brazilian Amazon and that the implementation of the HBV vaccination in rural Lábrea had little or no impact on the spread of HDV. This shows that HDV has not yet disappeared from HBV hyperendemic areas and reminding that it is far from being a vanishing disease in the Amazon basin.

INTRODUÇÃO: É descrito declínio na ocorrência do vírus da hepatite D (VHD) na Europa e Ásia. Estimamos a prevalência de infecção pelo VHD na Amazônia Ocidental, após a introdução da vacinação contra hepatite B. MÉTODOS: Este é um estudo de corte transversal da prevalência do VHD medido pela ocorrência de anticorpos totais (anti-HD T). RESULTADOS: A prevalência do VHD encontrada foi 41,9% entre os portadores do HBsAg, e esteve associado à idade (RP = 1,96; IC 95% 1,12-3,42; p = 0,01), infecção pelo HBV (RP = 4,38; IC 95% 3,12-6,13; p < 0,001) e história clínica de hepatite (RP =1,44; IC 95% 1,03-2,00; p = 0,03). Fatores de risco mostraram-se associados à biologia do HDV, aspectos clínicos e demográficos como infecção prévia pelo VHB e idade. CONCLUSÕES: O estudo demonstra que a infecção pelo VHD continua sendo um importante problema de saúde pública na região, e que a implantação da vacinação contra o VHB na área rural de Lábrea teve um impacto pouco significativo no controle do VHD, percebe-se que este ainda não desapareceu de áreas hiperendêmicas do VHB, e está longe de poder ser classificado como uma doença em declínio na bacia Amazônica.

Depressão pós-viral: análise crítica e revisão da literatura / Postviral depression: critical analysis and review of literature

Sintomas depressivos ocorrem frequentemente durante ou após infecções virais. Contudo a importância deste fato ou suas implicações clínicas não estão elucidadas. Objetivo: avaliar a relação entre infecções virais e episódio depressivo maior. Método: foi realizada uma revisão sistemática de artigos da literatura médica, usando palavras-chave da língua inglesa como "major depression, virus illness, postviral depression, chronic fatigue syndorme, depressive illness, utilizando para pesquisa as seguintes bases de dados: PubMed, Lilacs, Medline e Cochrane Library. Elaborou-se uma tabulação com as características clínicas de cada estudo. Resutado: a busca realizada evidenciou 14 artigos tendo sido excluído um deles por tratar de relato de dois casos. Dos 13 artigos selecionados, nove foram do tipo caso-controle e o restante de coortes. Entre os trabalhos de coorte a média na duração do acompanhamento foi de dez meses. Apenas cinco artigos encontraram ou sugeriran associação entre infecção viral e depressão. Desses, três são de caso-controle e dois de coorte. Conclusão: concluímos que não existem dados suficientes na literatura para demonstrar uma relação de causa-efeito entre infecções virais e depressão maior.

Contribuiçäo ao conhecimento sobre a Hantavirose no Brasil / A contribution to the knowledge of hantaviruses in Brazil

Foram revistos diferentes aspectos da síndrome pulmonar e cardiovascular por hantavírus, uma doença emergente transmitida pela inalação das excretas de roedores silvestres e que ocorre principalmente em indivíduos que têm contato com o meio rural e com estes animais. Trata-se de doença grave, com letalidade acima de 50%, que leva à insuficiência respiratória e ao choque. A terapia de suporte ventilatório e cardiovascular deve ser precocemente instituída, preferencialmente em unidades de terapia intensiva. A presença de edema pulmonar exige cuidados de ventilação precoces. Apesar dos pacientes apresentarem-se em choque, deve-se ter cuidados com a infusão de líquidos para que não se agrave o edema pulmonar. É necessário informar os profissionais de saúde sobre a doença, considerando que muitos casos devem passar despercebidos. O diagnóstico laboratorial de hantavirose acessível e rápido precisa ser implementado e para tanto, precisa-se de pesquisas desenvolvendo métodos diagnósticos sensíveis e confiáveis. O controle da doença exige envolvimento de múltiplos profissionais visando conhecer sua história natural, a biologia do reservatório e a do vírus.

Hantavirus pulmonary and cardiovascular syndrome, an emerging disease transmitted by the inhalation of wild rodent excreta and affecting mostly agriculture workers and other professionals in contact with these animals, is reviewed. Hantavirus pulmonary syndrome is a severe disease with case fatality ratio greater than 50%. The syndrome is characterized by respiratory distress and shock. Disease management includes early mechanical ventilation and volume administration, preferable in intensive care units. Caution is advised during liquid infusion for shock treatment since pulmonary edema develops frequently. Information about hantavirus pulmonary and cardiovascular syndrome should be widely disseminated among the Brazilian medical community considering that, many cases can be undiagnosed. Rapid and accessible laboratory diagnosis of hantaviruses must be implemented in Brazil and research focused on the development of sensible and reliable diagnostic methods and reagents is encouraged. The control of hantaviruses depends on a multi-professional approach aiming to know the natural history, the biology of the reservoir and of the virus.